Responsables : Dr V. KEPENEKIAN / Dr N. BENZERDJEB
Présentation
L’équipe est structurée autour de 4 axes complémentaires :
- Des méthologies afin identifier de nouveaux biomarqueurs circulants en oncologie, visant à mesurer l’éligibilité à des thérapies ciblées au diagnostic, la maladie résiduelle pendant le traitement, l’efficacité thérapeutique, la charge tumorale dans le plasma à différentes étapes de la prise en charge des patients et à mieux identifier ceux présentant une maladie agressive.
- Adaptation des traitements selon des données pharmacocinétique et pharmacogénétique en oncologie en association ou non à des traitements de support (antidouleurs, antipsychotiques…).
- Exploration histomoléculaire des tumeurs pour approfondir leur compréhension et optimiser la prise en charge thérapeutique.
- Des outils basés sur des approches par intelligence artificielle (IA) pour prédire différentes taches comme la survie, la réponse à des traitements, ou encore à des profils transcriptomiques à partir des données histologiques et/ou à partir de bases de données clinico-biologiques (RENAPE, BIGRENAPE).
Objectifs
La thématique globale de l’équipe porte sur l’amélioration des méthodes de quantification des biomarqueurs cliniques circulants (ADN tumoral circulant, cellules tumorales circulantes, complexes protéiques circulants, vésicules extracellulaires, et exosomes) ou à valider leur valeur pronostique ou prédictive.
L’équipe se concentre sur l’identification et l’évaluation de la valeur pronostique et prédictive des biomarqueurs circulants ou de nouveaux biomarqueurs dans les cancers solides, incluant des approches histologiques, multiomiques, et par intelligence artificielle.
Les travaux portent notamment sur la détection des altérations génétiques somatiques dans l’ADN tumoral circulant (ctDNA), les marqueurs tumoraux sériques et l’étude des cellules tumorales circulantes (CTC) dans les cancers solides, et plus récemment, l’apport de l’intelligence artificielle en en clinique, en histologie, en biologie moléculaire, et en multi-omique.
L’objectif est d’améliorer la stratification des patients en fonction de l’agressivité tumorale et de l’efficacité des traitements, notamment la chirurgie, la chimiothérapie et les thérapies ciblées.
Notre équipe
Dr David BARTHELEMY
MCUPH – Service de Biochimie, Pharmaco-Toxicologie et Biologie Moléculaire
Dr Lara CHALABREYSSE
MCUPH – Service d’Anatomie et Cytologie Pathologiques
Dr Anthony CITTERIO-QUENTIN
PH – Service de Biochimie, Pharmaco-Toxicologie et Biologie Moléculaire
Dr Alexis TRECOURT
AHU – Service d’Anatomie et Cytologie Pathologiques / Etudiant en thèse de sciences
Michel PEOCH
PU-PH CHU St Etienne
Antoine RICHARD
Chercheur
Olivier TIFFET
PU-PH CHU St Etienne
Nos partenaires
Sponsors et collaborations
Partenaires institutionnels
Partenaires industriels
Nos axes de recherche
- Équipe 1
L’intelligence artificielle au service de la médecine personnalisée
Le développement de nouveaux outils basés sur l’intelligence artificielle (IA) est devenu l’un des axes forts de notre équipe. Notre objectif est de prédire des paramètres cliniques tels que la [...]
- Équipe 1
Les cellules tumorales circulantes (CTC) : un outil clinique prometteur
Les CTC offrent des informations essentielles sur les caractéristiques biologiques des tumeurs. En analysant leurs profils génétiques, transcriptomiques ou protéomiques, il est possible d’identifier des mutations spécifiques, des biomarqueurs de [...]
Publications
2024
Performance of a Region of Interest-based Algorithm in Diagnosing International Society of Urological Pathology Grade Group ≥2 Prostate Cancer on the MRI-FIRST Database-CAD-FIRST Study
Thibaut Couchoux, Tristan Jaouen, Christelle Melodelima-Gonindard, Pierre Baseilhac, Arthur Branchu, Nicolas Arfi, Richard Aziza, Nicolas Barry Delongchamps, Franck Bladou, Flavie Bratan, Serge Brunelle, Pierre Colin, Jean-Michel Correas, François Cornud, Jean-Luc Descotes, Pascal Eschwege, Gaelle Fiard, Bénédicte Guillaume, Rémi Grange, Nicolas Grenier, Hervé Lang, Frédéric Lefèvre, Bernard Malavaud, Clément Marcelin, Paul C Moldovan, Nicolas Mottet, Pierre Mozer, Eric Potiron, Daniel Portalez, Philippe Puech, Raphaele Renard-Penna, Matthieu Roumiguié, Catherine Roy, Marc-Olivier Timsit, Thibault Tricard, Arnauld Villers, Jochen Walz, Sabine Debeer, Adeline Mansuy, Florence Mège-Lechevallier, Myriam Decaussin-Petrucci, Lionel Badet, Marc Colombel, Alain Ruffion, Sébastien Crouzet, Muriel Rabilloud, Rémi Souchon, Olivier Rouvière
Affiliations Expand PMID: 38493072 DOI: 10.1016/j.euo.2024.03.003
2024
Pulmonary inflammation decreases with ultra-protective ventilation in experimental ARDS under VV-ECMO: a positron emission tomography study
Guillaume Deniel, François Dhelft, Sophie Lancelot, Maciej Orkisz, Emmanuel Roux, William Mouton, Nazim Benzerdjeb, Jean-Christophe Richard, Laurent Bitker
Affiliations Expand PMID: 38444415 PMCID: PMC10912585 DOI: 10.3389/fmed.2024.1338602
2024
Cytoreductive Surgery and Hyperthermic Intraperitoneal Chemotherapy to Treat Pseudomyxoma Peritonei of Ovarian Origin: A Retrospective French RENAPE Group Study
Alexis Trecourt, Naoual Bakrin, Olivier Glehen, Witold Gertych, Laurent Villeneuve, Sylvie Isaac, Nazim Benzerdjeb, Juliette Fontaine, Catherine Genestie, Peggy Dartigues, Agnès Leroux, François Quenet, Frederic Marchal, Cecile Odin, Lakhdar Khellaf, Magali Svrcek, Sixte Thierry, Marilyn Augros, Alhadeedi Omar, Mojgan Devouassoux-Shisheboran, Vahan Kepenekian
RENAPE Group Collaborators, Affiliations Expand PMID: 38341381 PMCID: PMC10997733 DOI: 10.1245/s10434-023-14850-0
2024
SOX10-Internal Tandem Duplications and PLAG1 or HMGA2 Fusions Segregate Eccrine-Type and Apocrine-Type Cutaneous Mixed Tumors
Nicolas Macagno, Thibault Kervarrec, Soumanth Thanguturi, Pierre Sohier, Daniel Pissaloux, Lenaïg Mescam, Marie-Laure Jullie, Eric Frouin, Amelie Osio, Monique Faisant, François Le Loarer, Bernard Cribier, Eduardo Calonje, Evelyn Vanesa Erazo Luna, Daniela Massi, Keisuke Goto, Haruto Nishida, Sandrine Paindavoine, Aurelie Houlier, Juliet Tantot, Nazim Benzerdjeb, Franck Tirode, Arnaud De la Fouchardière, Maxime Battistella
Affiliations Expand PMID: 38266920 DOI: 10.1016/j.modpat.2024.100430
2024
ASO Author Reflections: Selected Multisite Metastatic Colorectal Cancer Patients May Benefit from Radical Multimodal Treatment
Vahan Kepenekian, Rémi Grange, Guillaume Passot, Olivier Glehen, Pascal Rousset
Affiliations Expand PMID: 38240899 DOI: 10.1245/s10434-024-14929-2
2024
Lung cancer screening by low-dose CT scan in France: final results of the DEP KP80 study after three rounds
Olivier Leleu, Nicolas Storme, Damien Basille, Marianne Auquier, Valerie Petigny, Pascal Berna, Alexia Letierce, Sebastien Couraud, Julie de Bermont, Bernard Milleron, Vincent Jounieaux
Affiliations Expand PMID: 39396424 PMCID: PMC11663785 DOI: 10.1016/j.ebiom.2024.105396
2024
Eliminating the need for preoperative intravenous hyperhydration: Sodium thiosulfate as nephrotoxicity prevention in HIPEC-treated patients – A retrospective analysis
Elea Vachez, Amaniel Kefleyesus, Naoual Bakrin, Florence Ranchon, Catherine Rioufol, Olivia Vassal, Omar Al-Hadeedi, Vahan Kepenekian, Olivier Glehen
Affiliations Expand PMID: 38219699 DOI: 10.1016/j.ejso.2024.107955
2024
Large B-cell lymphomas with CCND1 rearrangement have different immunoglobulin gene breakpoints and genomic profile than mantle cell lymphoma
Ece Özoğul , Anna Montaner, Melina Pol, Gerard Frigola, Olga Balagué, Charlotte Syrykh, Pablo Bousquets-Muñoz, Romina Royo, Juliette Fontaine, Alexandra Traverse-Glehen, Marco M Bühler, Luca Giudici, Marco Roncador, Thorsten Zenz, Sylvain Carras, Severine Valmary-Degano, Laurence de Leval, Jan Bosch-Schips, Fina Climent, Julia Salmeron-Villalobos, Melika Bashiri, Silvia Ruiz-Gaspà, Dolors Costa, Sílvia Beà, Itziar Salaverria, Eva Giné, Leticia Quintanilla-Martinez, Pierre Brousset, Mark Raffeld, Elaine S Jaffe, Xose S Puente, Cristina López, Ferran Nadeu, Elias Campo
Affiliations Expand PMID: 39313500 PMCID: PMC11420347 DOI: 10.1038/s41408-024-01146-z
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